Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms