Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ythdc2B2RR83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms