Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf3B2KF05 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms