Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mbd5B1AYB6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Mbd5B1AYB6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms