Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms