Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms