Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik3B1AS29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms