Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhox1B1APN4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms