Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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