Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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