Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3173A6NAS3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3173A6NAS3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms