Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxl16A2RT62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxl16A2RT62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms