Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xlr4aA2BI40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xlr4aA2BI40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms