Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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