Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll9A2APC3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms