Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabreA2AMW3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms