Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
AI481877A2ALV5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AI481877A2ALV5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AI481877A2ALV5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms