Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930447F04RikA2AFR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930447F04RikA2AFR2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930447F04RikA2AFR2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930447F04RikA2AFR2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms