Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms