Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem185aA2AF53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms