Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprfA2A8L5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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