Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsg1A2A825 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rsg1A2A825 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms