Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm6268A2A3U9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm6268A2A3U9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms