Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms