Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam71e1A1L3C1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms