Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms