Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms