Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms