Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI67

Frmpd2, FERM and PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd2A0A140LI67 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd2A0A140LI67 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd2A0A140LI67 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms