Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms