Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms