Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU041133A0A0J9YVH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AU041133A0A0J9YVH3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms