Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms