Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms