Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms