Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms