Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt16Q9Z2K1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms