Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd4Q9Z2D7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms