Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip6Q9Z1Y4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms