Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ap3b1Q9Z1T1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms