Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf394Q9Z1D9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf394Q9Z1D9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms