Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf1Q9Z1B8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf1Q9Z1B8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms