Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms