Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms