Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Oc90Q9Z0L3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Oc90Q9Z0L3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms