Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms