Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin2Q9WVE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms