Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapaQ9WV55 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapaQ9WV55 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms