Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ArcQ9WV31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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ArcQ9WV31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ArcQ9WV31 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms