Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50aQ9WV03 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50aQ9WV03 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms